Devenu fonds de dotation en 2016, Entreprises et Cités est habilité à recevoir des dons pour financer des projets d'intérêt général. Ces dons, provenant d'entreprises, sont complétés par Entreprises et Cités, qui verse une partie des dividendes issus des structures dont il est actionnaire. D'un montant de 2 M€ par an, cette enveloppe sera investie dans une dizaine de projets par an, tous à but non-lucratif, sélectionnés selon leur effet sur l'attractivité du territoire, l'innovation, ou l'excellence territoriale.
