Après les élections pour le renouvellement des conseils centraux de l'université, qui se sont tenues le 30 novembre et le 1er décembre 2015, le conseil d'administration de l'université Toulouse 3 - Paul Sabatier s'est réuni le 4 janvier pour élire le nouveau président, qui prend la suite de Bertrand Monthubert. Deux candidats se sont déclarés : Jean-Pierre Vinel a été élu président de l'université par 23 voix « pour » ; 4 voix sont allées à Jean-Marc Broto et 7 voix ont été décomptées comme «vote blanc».
Ancien étudiant de l’université Toulouse 3 – Paul Sabatier, spécialiste des maladies de l’appareil digestif, Jean-Pierre Vinel a assumé des fonctions de responsabilité au CHU de Toulouse (président de la Commission médicale d’établissement de 2003 à 2007) et à l’université : président de la sous-section du CNU et de la collégiale des enseignants de sa discipline (de 2007 à 2009), doyen de la faculté de médecine Purpan (depuis 2009), président de la Conférence des doyens de facultés de médecine (depuis 2014).
Son activité de chercheur a été initiée à la Yale University, puis au profit d’unités labellisées ( CJF, EA 2405, Unité 531 puis 858 de l’Inserm). Il préside depuis 2008 le Comité régional de coordination de la recherche biomédicale et en santé publique (CRBSP).
Bertrand Monthubert, qui a démissionné cette automne, est remplacé à la présidence de l'université Paul Sabatier par Jean-Pierre Vinel, spécialiste des maladies de l’appareil digestif.