A fin 2020, Valneva affichait une trésorerie de 204,4 millions d'euros, supérieure aux prévisions du groupe d’une trésorerie se situant entre 180 millions et 200 millions d'euros. La trésorerie à fin 2020 inclut 130 millions de dollars provenant de la collaboration avec Pfizer pour la maladie de Lyme et 96,7 millions d'euros provenant de l’accord avec le Royaume-Uni pour le candidat vaccin contre la COVID-19. Aucun nouveau tirage n'a été effectué au second semestre dans le cadre de l’accord de financement de 85 millions de dollars mis en place avec les fonds d’investissement américains Deerfield et Orbimed (60 millions de dollars tirés au premier semestre 2020).
